Protein–RNA interactions for Protein: P01680

Ig kappa chain V-IV region S107B, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01680 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01680 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01680 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
P01680 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01680 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01680 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01680 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01680 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01680 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01680 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01680 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01680 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01680 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01680 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
P01680 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01680 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01680 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01680 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01680 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01680 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01680 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01680 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01680 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01680 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01680 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01680 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01680 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01680 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01680 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01680 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P01680 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01680 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01680 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01680 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P01680 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01680 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01680 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01680 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01680 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01680 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01680 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P01680 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01680 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01680 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01680 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01680 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01680 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01680 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01680 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01680 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01680 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01680 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01680 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01680 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01680 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01680 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01680 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01680 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01680 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01680 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01680 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01680 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01680 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01680 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01680 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01680 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01680 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01680 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01680 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P01680 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01680 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01680 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01680 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01680 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01680 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01680 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01680 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01680 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01680 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01680 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01680 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01680 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01680 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01680 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01680 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01680 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01680 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01680 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01680 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01680 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01680 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01680 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01680 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01680 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01680 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01680 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01680 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01680 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01680 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01680 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms