Protein–RNA interactions for Protein: P01655

Ig kappa chain V-III region PC 7132, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01655 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01655 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01655 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01655 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01655 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01655 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01655 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01655 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01655 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01655 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01655 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01655 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01655 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01655 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01655 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01655 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01655 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01655 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01655 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01655 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01655 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01655 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01655 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01655 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01655 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01655 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01655 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01655 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01655 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01655 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01655 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01655 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01655 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01655 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P01655 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P01655 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01655 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01655 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01655 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01655 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01655 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01655 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01655 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01655 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01655 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01655 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01655 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01655 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P01655 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01655 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01655 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01655 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01655 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P01655 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01655 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01655 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P01655 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01655 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01655 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01655 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01655 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P01655 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01655 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P01655 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01655 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01655 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01655 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01655 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01655 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01655 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01655 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01655 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01655 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01655 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01655 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01655 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01655 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01655 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
P01655 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01655 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01655 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01655 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01655 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
P01655 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
P01655 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01655 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01655 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01655 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01655 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01655 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01655 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P01655 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01655 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01655 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01655 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01655 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01655 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P01655 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01655 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P01655 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms