Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01649 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01649 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01649 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01649 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01649 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01649 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01649 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01649 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01649 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01649 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01649 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01649 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01649 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01649 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01649 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01649 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01649 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01649 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01649 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01649 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01649 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01649 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01649 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01649 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01649 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P01649 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01649 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01649 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01649 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01649 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01649 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01649 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01649 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01649 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01649 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01649 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01649 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01649 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01649 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01649 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01649 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01649 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P01649 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01649 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01649 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01649 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01649 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01649 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01649 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01649 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01649 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01649 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01649 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01649 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01649 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01649 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01649 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01649 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01649 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01649 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01649 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01649 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01649 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01649 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01649 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01649 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01649 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01649 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01649 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P01649 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01649 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01649 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01649 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01649 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01649 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01649 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01649 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01649 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01649 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01649 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01649 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01649 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01649 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01649 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01649 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P01649 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01649 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01649 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01649 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01649 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01649 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01649 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01649 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01649 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01649 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01649 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01649 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01649 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01649 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms