Protein–RNA interactions for Protein: O89104

Sypl2, Synaptophysin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl2O89104 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sypl2O89104 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sypl2O89104 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sypl2O89104 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sypl2O89104 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sypl2O89104 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sypl2O89104 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sypl2O89104 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sypl2O89104 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sypl2O89104 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sypl2O89104 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sypl2O89104 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sypl2O89104 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sypl2O89104 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sypl2O89104 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sypl2O89104 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sypl2O89104 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sypl2O89104 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sypl2O89104 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sypl2O89104 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sypl2O89104 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sypl2O89104 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sypl2O89104 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sypl2O89104 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sypl2O89104 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sypl2O89104 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sypl2O89104 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sypl2O89104 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sypl2O89104 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sypl2O89104 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sypl2O89104 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sypl2O89104 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sypl2O89104 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sypl2O89104 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sypl2O89104 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sypl2O89104 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sypl2O89104 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sypl2O89104 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sypl2O89104 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sypl2O89104 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sypl2O89104 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sypl2O89104 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sypl2O89104 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sypl2O89104 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sypl2O89104 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sypl2O89104 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sypl2O89104 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sypl2O89104 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sypl2O89104 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sypl2O89104 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sypl2O89104 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sypl2O89104 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sypl2O89104 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sypl2O89104 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sypl2O89104 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sypl2O89104 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sypl2O89104 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sypl2O89104 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sypl2O89104 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sypl2O89104 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sypl2O89104 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sypl2O89104 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sypl2O89104 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sypl2O89104 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sypl2O89104 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sypl2O89104 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sypl2O89104 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sypl2O89104 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sypl2O89104 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sypl2O89104 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sypl2O89104 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sypl2O89104 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sypl2O89104 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sypl2O89104 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sypl2O89104 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sypl2O89104 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sypl2O89104 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sypl2O89104 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sypl2O89104 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sypl2O89104 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sypl2O89104 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sypl2O89104 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sypl2O89104 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sypl2O89104 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sypl2O89104 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sypl2O89104 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sypl2O89104 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sypl2O89104 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sypl2O89104 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sypl2O89104 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sypl2O89104 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sypl2O89104 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sypl2O89104 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sypl2O89104 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sypl2O89104 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sypl2O89104 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sypl2O89104 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sypl2O89104 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sypl2O89104 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sypl2O89104 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms