Protein–RNA interactions for Protein: O88974

Setdb1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setdb1O88974 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Setdb1O88974 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Setdb1O88974 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Setdb1O88974 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Setdb1O88974 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Setdb1O88974 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Setdb1O88974 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Setdb1O88974 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms