Protein–RNA interactions for Protein: O88958

Gnpda1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda1O88958 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gnpda1O88958 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gnpda1O88958 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gnpda1O88958 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gnpda1O88958 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gnpda1O88958 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gnpda1O88958 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gnpda1O88958 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gnpda1O88958 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gnpda1O88958 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gnpda1O88958 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gnpda1O88958 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gnpda1O88958 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gnpda1O88958 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gnpda1O88958 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gnpda1O88958 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gnpda1O88958 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gnpda1O88958 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gnpda1O88958 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gnpda1O88958 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gnpda1O88958 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gnpda1O88958 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gnpda1O88958 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gnpda1O88958 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gnpda1O88958 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gnpda1O88958 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gnpda1O88958 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gnpda1O88958 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gnpda1O88958 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gnpda1O88958 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gnpda1O88958 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gnpda1O88958 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gnpda1O88958 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gnpda1O88958 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gnpda1O88958 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gnpda1O88958 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gnpda1O88958 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gnpda1O88958 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gnpda1O88958 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gnpda1O88958 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gnpda1O88958 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gnpda1O88958 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gnpda1O88958 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gnpda1O88958 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gnpda1O88958 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gnpda1O88958 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gnpda1O88958 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gnpda1O88958 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gnpda1O88958 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gnpda1O88958 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gnpda1O88958 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gnpda1O88958 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gnpda1O88958 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gnpda1O88958 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gnpda1O88958 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gnpda1O88958 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gnpda1O88958 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gnpda1O88958 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gnpda1O88958 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gnpda1O88958 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gnpda1O88958 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gnpda1O88958 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gnpda1O88958 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gnpda1O88958 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gnpda1O88958 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gnpda1O88958 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gnpda1O88958 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gnpda1O88958 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gnpda1O88958 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gnpda1O88958 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gnpda1O88958 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gnpda1O88958 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gnpda1O88958 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gnpda1O88958 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gnpda1O88958 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gnpda1O88958 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gnpda1O88958 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gnpda1O88958 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gnpda1O88958 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gnpda1O88958 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gnpda1O88958 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gnpda1O88958 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gnpda1O88958 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gnpda1O88958 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gnpda1O88958 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gnpda1O88958 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gnpda1O88958 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gnpda1O88958 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gnpda1O88958 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gnpda1O88958 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gnpda1O88958 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gnpda1O88958 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gnpda1O88958 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gnpda1O88958 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gnpda1O88958 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gnpda1O88958 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gnpda1O88958 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gnpda1O88958 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gnpda1O88958 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gnpda1O88958 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms