Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Tom1O88746 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Tom1O88746 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Tom1O88746 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Tom1O88746 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Tom1O88746 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Tom1O88746 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tom1O88746 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tom1O88746 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tom1O88746 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tom1O88746 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tom1O88746 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tom1O88746 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tom1O88746 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tom1O88746 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Tom1O88746 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Tom1O88746 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tom1O88746 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tom1O88746 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tom1O88746 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tom1O88746 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tom1O88746 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tom1O88746 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tom1O88746 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tom1O88746 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tom1O88746 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tom1O88746 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tom1O88746 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tom1O88746 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tom1O88746 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tom1O88746 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tom1O88746 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tom1O88746 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tom1O88746 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tom1O88746 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tom1O88746 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tom1O88746 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tom1O88746 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tom1O88746 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tom1O88746 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tom1O88746 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tom1O88746 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tom1O88746 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tom1O88746 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tom1O88746 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Tom1O88746 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tom1O88746 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tom1O88746 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms