Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BlmO88700 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BlmO88700 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BlmO88700 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BlmO88700 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BlmO88700 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BlmO88700 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BlmO88700 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BlmO88700 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BlmO88700 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BlmO88700 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BlmO88700 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
BlmO88700 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
BlmO88700 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BlmO88700 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BlmO88700 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BlmO88700 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BlmO88700 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BlmO88700 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BlmO88700 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BlmO88700 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BlmO88700 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BlmO88700 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BlmO88700 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BlmO88700 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BlmO88700 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BlmO88700 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BlmO88700 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BlmO88700 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BlmO88700 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BlmO88700 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BlmO88700 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BlmO88700 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BlmO88700 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BlmO88700 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
BlmO88700 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
BlmO88700 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BlmO88700 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BlmO88700 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BlmO88700 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BlmO88700 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BlmO88700 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BlmO88700 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BlmO88700 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BlmO88700 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BlmO88700 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BlmO88700 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BlmO88700 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BlmO88700 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
BlmO88700 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BlmO88700 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BlmO88700 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BlmO88700 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BlmO88700 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BlmO88700 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BlmO88700 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BlmO88700 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BlmO88700 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BlmO88700 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BlmO88700 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BlmO88700 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BlmO88700 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BlmO88700 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BlmO88700 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BlmO88700 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BlmO88700 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BlmO88700 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BlmO88700 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BlmO88700 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BlmO88700 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BlmO88700 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BlmO88700 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BlmO88700 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BlmO88700 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BlmO88700 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BlmO88700 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BlmO88700 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BlmO88700 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BlmO88700 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BlmO88700 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BlmO88700 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
BlmO88700 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
BlmO88700 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
BlmO88700 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
BlmO88700 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
BlmO88700 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
BlmO88700 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BlmO88700 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BlmO88700 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BlmO88700 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
BlmO88700 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BlmO88700 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BlmO88700 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BlmO88700 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BlmO88700 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BlmO88700 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BlmO88700 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BlmO88700 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BlmO88700 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BlmO88700 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms