Protein–RNA interactions for Protein: O88627

Slc28a2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a2O88627 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc28a2O88627 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms