Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AurkcO88445 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AurkcO88445 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AurkcO88445 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AurkcO88445 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AurkcO88445 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms