Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme6O88425 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme6O88425 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme6O88425 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme6O88425 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme6O88425 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme6O88425 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme6O88425 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme6O88425 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms