Protein–RNA interactions for Protein: O88413

Tulp3, Tubby-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp3O88413 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tulp3O88413 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tulp3O88413 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tulp3O88413 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tulp3O88413 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tulp3O88413 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tulp3O88413 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tulp3O88413 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tulp3O88413 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tulp3O88413 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tulp3O88413 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tulp3O88413 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tulp3O88413 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tulp3O88413 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tulp3O88413 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tulp3O88413 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms