Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.8 ms