Protein–RNA interactions for Protein: O70589

Cask, Peripheral plasma membrane protein CASK, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaskO70589 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CaskO70589 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CaskO70589 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CaskO70589 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CaskO70589 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CaskO70589 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CaskO70589 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CaskO70589 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CaskO70589 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CaskO70589 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CaskO70589 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CaskO70589 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CaskO70589 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CaskO70589 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CaskO70589 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CaskO70589 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CaskO70589 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CaskO70589 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CaskO70589 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CaskO70589 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CaskO70589 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CaskO70589 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CaskO70589 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CaskO70589 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CaskO70589 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CaskO70589 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CaskO70589 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CaskO70589 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CaskO70589 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CaskO70589 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CaskO70589 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CaskO70589 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CaskO70589 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CaskO70589 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CaskO70589 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CaskO70589 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CaskO70589 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CaskO70589 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CaskO70589 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CaskO70589 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CaskO70589 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CaskO70589 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CaskO70589 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CaskO70589 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CaskO70589 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CaskO70589 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CaskO70589 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CaskO70589 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CaskO70589 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CaskO70589 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CaskO70589 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CaskO70589 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CaskO70589 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CaskO70589 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CaskO70589 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CaskO70589 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CaskO70589 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CaskO70589 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CaskO70589 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CaskO70589 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CaskO70589 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CaskO70589 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CaskO70589 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CaskO70589 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CaskO70589 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CaskO70589 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CaskO70589 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CaskO70589 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CaskO70589 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CaskO70589 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CaskO70589 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CaskO70589 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CaskO70589 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CaskO70589 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CaskO70589 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CaskO70589 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CaskO70589 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CaskO70589 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CaskO70589 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CaskO70589 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CaskO70589 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CaskO70589 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CaskO70589 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CaskO70589 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CaskO70589 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CaskO70589 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CaskO70589 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CaskO70589 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CaskO70589 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CaskO70589 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CaskO70589 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CaskO70589 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CaskO70589 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CaskO70589 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CaskO70589 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CaskO70589 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CaskO70589 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CaskO70589 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CaskO70589 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CaskO70589 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms