Protein–RNA interactions for Protein: O70492

Snx3, Sorting nexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx3O70492 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx3O70492 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx3O70492 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx3O70492 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx3O70492 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx3O70492 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx3O70492 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx3O70492 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx3O70492 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx3O70492 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms