Protein–RNA interactions for Protein: O70481

Ubr1, E3 ubiquitin-protein ligase UBR1, mousemouse

Predictions only

Length 1,757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubr1O70481 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubr1O70481 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubr1O70481 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubr1O70481 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubr1O70481 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubr1O70481 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubr1O70481 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubr1O70481 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubr1O70481 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubr1O70481 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubr1O70481 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubr1O70481 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubr1O70481 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubr1O70481 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubr1O70481 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubr1O70481 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubr1O70481 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubr1O70481 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubr1O70481 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubr1O70481 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubr1O70481 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubr1O70481 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubr1O70481 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubr1O70481 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubr1O70481 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubr1O70481 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubr1O70481 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubr1O70481 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubr1O70481 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubr1O70481 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ubr1O70481 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ubr1O70481 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ubr1O70481 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ubr1O70481 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ubr1O70481 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ubr1O70481 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ubr1O70481 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms