Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms