Protein–RNA interactions for Protein: O55237

Cd70, CD70 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd70O55237 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd70O55237 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd70O55237 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd70O55237 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd70O55237 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd70O55237 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd70O55237 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd70O55237 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd70O55237 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd70O55237 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd70O55237 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd70O55237 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd70O55237 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd70O55237 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd70O55237 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd70O55237 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd70O55237 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd70O55237 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd70O55237 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd70O55237 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd70O55237 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd70O55237 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd70O55237 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd70O55237 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd70O55237 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd70O55237 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd70O55237 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd70O55237 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd70O55237 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cd70O55237 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cd70O55237 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cd70O55237 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cd70O55237 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cd70O55237 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cd70O55237 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cd70O55237 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cd70O55237 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cd70O55237 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cd70O55237 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cd70O55237 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cd70O55237 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cd70O55237 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cd70O55237 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cd70O55237 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cd70O55237 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cd70O55237 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cd70O55237 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cd70O55237 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Cd70O55237 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cd70O55237 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cd70O55237 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cd70O55237 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cd70O55237 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cd70O55237 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cd70O55237 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd70O55237 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd70O55237 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd70O55237 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd70O55237 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd70O55237 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd70O55237 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd70O55237 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd70O55237 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd70O55237 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd70O55237 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd70O55237 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd70O55237 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd70O55237 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd70O55237 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cd70O55237 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cd70O55237 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cd70O55237 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cd70O55237 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cd70O55237 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cd70O55237 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cd70O55237 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cd70O55237 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cd70O55237 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cd70O55237 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cd70O55237 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cd70O55237 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cd70O55237 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cd70O55237 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cd70O55237 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cd70O55237 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd70O55237 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd70O55237 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd70O55237 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd70O55237 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd70O55237 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd70O55237 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd70O55237 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd70O55237 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd70O55237 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd70O55237 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd70O55237 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd70O55237 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd70O55237 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd70O55237 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd70O55237 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms