Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Supt5hO55201 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms