Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms