Protein–RNA interactions for Protein: O55127

Cyp26a1, Cytochrome P450 26A1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26a1O55127 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp26a1O55127 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms