Protein–RNA interactions for Protein: O54965

Rnf13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf13O54965 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf13O54965 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf13O54965 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf13O54965 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf13O54965 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf13O54965 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf13O54965 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf13O54965 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf13O54965 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf13O54965 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf13O54965 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf13O54965 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf13O54965 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf13O54965 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf13O54965 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf13O54965 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf13O54965 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf13O54965 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf13O54965 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf13O54965 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf13O54965 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf13O54965 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf13O54965 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf13O54965 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf13O54965 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf13O54965 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf13O54965 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf13O54965 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf13O54965 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf13O54965 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf13O54965 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf13O54965 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf13O54965 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf13O54965 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf13O54965 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf13O54965 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf13O54965 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf13O54965 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf13O54965 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf13O54965 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf13O54965 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf13O54965 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf13O54965 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf13O54965 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf13O54965 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Rnf13O54965 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf13O54965 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf13O54965 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf13O54965 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf13O54965 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf13O54965 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf13O54965 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf13O54965 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf13O54965 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf13O54965 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf13O54965 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf13O54965 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf13O54965 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf13O54965 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf13O54965 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf13O54965 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf13O54965 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf13O54965 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf13O54965 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf13O54965 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf13O54965 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf13O54965 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf13O54965 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf13O54965 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf13O54965 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf13O54965 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf13O54965 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf13O54965 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf13O54965 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf13O54965 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf13O54965 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf13O54965 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf13O54965 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf13O54965 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf13O54965 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf13O54965 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf13O54965 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf13O54965 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf13O54965 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf13O54965 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf13O54965 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf13O54965 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf13O54965 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf13O54965 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf13O54965 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf13O54965 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf13O54965 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf13O54965 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf13O54965 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf13O54965 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf13O54965 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf13O54965 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf13O54965 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf13O54965 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf13O54965 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms