Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms