Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CrxO54751 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CrxO54751 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CrxO54751 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CrxO54751 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CrxO54751 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CrxO54751 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CrxO54751 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CrxO54751 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CrxO54751 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CrxO54751 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CrxO54751 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CrxO54751 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CrxO54751 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CrxO54751 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CrxO54751 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CrxO54751 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CrxO54751 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CrxO54751 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CrxO54751 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CrxO54751 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CrxO54751 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CrxO54751 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CrxO54751 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CrxO54751 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CrxO54751 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CrxO54751 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CrxO54751 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CrxO54751 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CrxO54751 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CrxO54751 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CrxO54751 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CrxO54751 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CrxO54751 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CrxO54751 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CrxO54751 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CrxO54751 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CrxO54751 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CrxO54751 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CrxO54751 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CrxO54751 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CrxO54751 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CrxO54751 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CrxO54751 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CrxO54751 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CrxO54751 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CrxO54751 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CrxO54751 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CrxO54751 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CrxO54751 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CrxO54751 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CrxO54751 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CrxO54751 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CrxO54751 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CrxO54751 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CrxO54751 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CrxO54751 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CrxO54751 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CrxO54751 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CrxO54751 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CrxO54751 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CrxO54751 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CrxO54751 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CrxO54751 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CrxO54751 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CrxO54751 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
CrxO54751 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CrxO54751 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CrxO54751 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CrxO54751 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CrxO54751 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CrxO54751 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CrxO54751 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CrxO54751 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CrxO54751 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CrxO54751 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CrxO54751 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CrxO54751 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CrxO54751 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CrxO54751 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CrxO54751 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CrxO54751 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CrxO54751 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CrxO54751 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CrxO54751 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CrxO54751 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CrxO54751 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CrxO54751 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CrxO54751 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CrxO54751 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CrxO54751 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CrxO54751 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CrxO54751 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CrxO54751 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CrxO54751 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CrxO54751 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CrxO54751 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CrxO54751 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
CrxO54751 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CrxO54751 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms