Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdc4O35988 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms