Protein–RNA interactions for Protein: O35912

Emp3, Epithelial membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emp3O35912 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Emp3O35912 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Emp3O35912 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Emp3O35912 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Emp3O35912 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Emp3O35912 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Emp3O35912 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Emp3O35912 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Emp3O35912 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Emp3O35912 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Emp3O35912 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Emp3O35912 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Emp3O35912 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Emp3O35912 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Emp3O35912 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Emp3O35912 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Emp3O35912 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Emp3O35912 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Emp3O35912 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Emp3O35912 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Emp3O35912 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Emp3O35912 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Emp3O35912 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Emp3O35912 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Emp3O35912 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Emp3O35912 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Emp3O35912 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Emp3O35912 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Emp3O35912 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Emp3O35912 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Emp3O35912 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Emp3O35912 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Emp3O35912 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Emp3O35912 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Emp3O35912 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Emp3O35912 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Emp3O35912 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Emp3O35912 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Emp3O35912 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Emp3O35912 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Emp3O35912 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Emp3O35912 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Emp3O35912 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Emp3O35912 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Emp3O35912 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Emp3O35912 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Emp3O35912 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Emp3O35912 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Emp3O35912 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Emp3O35912 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Emp3O35912 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Emp3O35912 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Emp3O35912 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Emp3O35912 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Emp3O35912 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Emp3O35912 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Emp3O35912 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Emp3O35912 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Emp3O35912 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Emp3O35912 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Emp3O35912 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Emp3O35912 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Emp3O35912 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Emp3O35912 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Emp3O35912 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Emp3O35912 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Emp3O35912 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Emp3O35912 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Emp3O35912 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Emp3O35912 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Emp3O35912 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Emp3O35912 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Emp3O35912 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Emp3O35912 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Emp3O35912 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Emp3O35912 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Emp3O35912 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Emp3O35912 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Emp3O35912 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Emp3O35912 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Emp3O35912 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Emp3O35912 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Emp3O35912 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Emp3O35912 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Emp3O35912 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Emp3O35912 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Emp3O35912 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Emp3O35912 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Emp3O35912 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Emp3O35912 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Emp3O35912 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Emp3O35912 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Emp3O35912 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Emp3O35912 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Emp3O35912 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Emp3O35912 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Emp3O35912 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Emp3O35912 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Emp3O35912 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Emp3O35912 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms