Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
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Tnfrsf18O35714 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfrsf18O35714 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfrsf18O35714 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfrsf18O35714 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfrsf18O35714 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfrsf18O35714 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfrsf18O35714 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfrsf18O35714 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfrsf18O35714 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfrsf18O35714 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfrsf18O35714 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfrsf18O35714 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfrsf18O35714 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfrsf18O35714 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfrsf18O35714 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Tnfrsf18O35714 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfrsf18O35714 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfrsf18O35714 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Tnfrsf18O35714 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfrsf18O35714 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfrsf18O35714 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfrsf18O35714 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfrsf18O35714 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfrsf18O35714 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfrsf18O35714 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfrsf18O35714 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfrsf18O35714 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Tnfrsf18O35714 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfrsf18O35714 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Tnfrsf18O35714 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfrsf18O35714 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
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Tnfrsf18O35714 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Tnfrsf18O35714 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfrsf18O35714 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfrsf18O35714 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Tnfrsf18O35714 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Tnfrsf18O35714 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfrsf18O35714 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Tnfrsf18O35714 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf18O35714 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf18O35714 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf18O35714 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Tnfrsf18O35714 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf18O35714 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf18O35714 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf18O35714 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf18O35714 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf18O35714 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Tnfrsf18O35714 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf18O35714 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf18O35714 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf18O35714 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf18O35714 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf18O35714 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf18O35714 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf18O35714 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf18O35714 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf18O35714 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf18O35714 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf18O35714 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf18O35714 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf18O35714 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf18O35714 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf18O35714 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf18O35714 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf18O35714 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf18O35714 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf18O35714 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf18O35714 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf18O35714 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf18O35714 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms