Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Gm11491-201ENSMUST00000129441 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lhx8O35652 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lhx8O35652 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lhx8O35652 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lhx8O35652 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Lhx8O35652 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lhx8O35652 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lhx8O35652 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lhx8O35652 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lhx8O35652 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lhx8O35652 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lhx8O35652 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lhx8O35652 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx8O35652 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx8O35652 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx8O35652 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx8O35652 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx8O35652 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx8O35652 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx8O35652 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx8O35652 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx8O35652 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx8O35652 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx8O35652 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx8O35652 Hprt-201ENSMUST00000026723 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx8O35652 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx8O35652 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx8O35652 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx8O35652 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx8O35652 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx8O35652 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx8O35652 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx8O35652 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lhx8O35652 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lhx8O35652 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lhx8O35652 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lhx8O35652 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lhx8O35652 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lhx8O35652 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lhx8O35652 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lhx8O35652 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lhx8O35652 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lhx8O35652 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lhx8O35652 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lhx8O35652 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lhx8O35652 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lhx8O35652 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lhx8O35652 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lhx8O35652 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lhx8O35652 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lhx8O35652 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lhx8O35652 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lhx8O35652 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lhx8O35652 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lhx8O35652 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lhx8O35652 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lhx8O35652 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lhx8O35652 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lhx8O35652 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lhx8O35652 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lhx8O35652 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Lhx8O35652 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lhx8O35652 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Lhx8O35652 Gm3476-203ENSMUST00000190582 612 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lhx8O35652 Gm37809-201ENSMUST00000195050 931 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Lhx8O35652 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Lhx8O35652 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lhx8O35652 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lhx8O35652 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lhx8O35652 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lhx8O35652 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lhx8O35652 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lhx8O35652 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lhx8O35652 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lhx8O35652 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Lhx8O35652 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lhx8O35652 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lhx8O35652 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lhx8O35652 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lhx8O35652 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Lhx8O35652 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lhx8O35652 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lhx8O35652 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lhx8O35652 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lhx8O35652 Gm4207-201ENSMUST00000173144 960 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Lhx8O35652 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Lhx8O35652 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Lhx8O35652 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lhx8O35652 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lhx8O35652 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lhx8O35652 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lhx8O35652 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lhx8O35652 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lhx8O35652 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lhx8O35652 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lhx8O35652 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lhx8O35652 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lhx8O35652 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lhx8O35652 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lhx8O35652 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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