Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc27a2O35488 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms