Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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