Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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