Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

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Length 457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
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ColqO35348 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ColqO35348 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ColqO35348 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ColqO35348 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ColqO35348 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ColqO35348 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ColqO35348 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ColqO35348 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ColqO35348 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ColqO35348 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ColqO35348 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ColqO35348 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ColqO35348 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ColqO35348 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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ColqO35348 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ColqO35348 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ColqO35348 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
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ColqO35348 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
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ColqO35348 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ColqO35348 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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ColqO35348 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ColqO35348 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ColqO35348 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ColqO35348 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ColqO35348 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ColqO35348 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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ColqO35348 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ColqO35348 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ColqO35348 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ColqO35348 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ColqO35348 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ColqO35348 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ColqO35348 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ColqO35348 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ColqO35348 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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ColqO35348 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ColqO35348 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ColqO35348 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ColqO35348 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ColqO35348 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ColqO35348 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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ColqO35348 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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ColqO35348 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ColqO35348 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ColqO35348 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ColqO35348 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ColqO35348 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ColqO35348 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ColqO35348 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ColqO35348 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ColqO35348 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ColqO35348 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ColqO35348 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ColqO35348 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ColqO35348 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ColqO35348 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ColqO35348 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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ColqO35348 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ColqO35348 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ColqO35348 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ColqO35348 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ColqO35348 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ColqO35348 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ColqO35348 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms