Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pkd2O35245 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pkd2O35245 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pkd2O35245 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pkd2O35245 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Pkd2O35245 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Pkd2O35245 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pkd2O35245 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pkd2O35245 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pkd2O35245 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pkd2O35245 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Pkd2O35245 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Pkd2O35245 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pkd2O35245 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pkd2O35245 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Pkd2O35245 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Pkd2O35245 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pkd2O35245 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pkd2O35245 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pkd2O35245 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pkd2O35245 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pkd2O35245 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Pkd2O35245 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pkd2O35245 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pkd2O35245 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pkd2O35245 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pkd2O35245 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pkd2O35245 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pkd2O35245 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pkd2O35245 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pkd2O35245 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pkd2O35245 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pkd2O35245 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pkd2O35245 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pkd2O35245 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pkd2O35245 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms