Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-Q1O19441 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-Q1O19441 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-Q1O19441 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-Q1O19441 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-Q1O19441 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-Q1O19441 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-Q1O19441 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-Q1O19441 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-Q1O19441 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-Q1O19441 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-Q1O19441 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-Q1O19441 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-Q1O19441 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
H2-Q1O19441 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
H2-Q1O19441 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
H2-Q1O19441 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-Q1O19441 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 217 ms