Protein–RNA interactions for Protein: O08750

Nfil3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfil3O08750 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nfil3O08750 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nfil3O08750 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nfil3O08750 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nfil3O08750 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nfil3O08750 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nfil3O08750 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nfil3O08750 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nfil3O08750 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nfil3O08750 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nfil3O08750 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms