Protein–RNA interactions for Protein: L7N298

Gm3424, Predicted gene 3424, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3424L7N298 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3424L7N298 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3424L7N298 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3424L7N298 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3424L7N298 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3424L7N298 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3424L7N298 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3424L7N298 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3424L7N298 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3424L7N298 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3424L7N298 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3424L7N298 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3424L7N298 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3424L7N298 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3424L7N298 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3424L7N298 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3424L7N298 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3424L7N298 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm3424L7N298 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm3424L7N298 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm3424L7N298 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3424L7N298 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms