Protein–RNA interactions for Protein: L7N248

Gm6871, Predicted gene 6871, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6871L7N248 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6871L7N248 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm6871L7N248 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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