Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20878L7N244 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm20878L7N244 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm20878L7N244 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm20878L7N244 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20878L7N244 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20878L7N244 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20878L7N244 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20878L7N244 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20878L7N244 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20878L7N244 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20878L7N244 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20878L7N244 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20878L7N244 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20878L7N244 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20878L7N244 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20878L7N244 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20878L7N244 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20878L7N244 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20878L7N244 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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