Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm2035J3QP87 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm2035J3QP87 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm2035J3QP87 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm2035J3QP87 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm2035J3QP87 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm2035J3QP87 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm2035J3QP87 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm2035J3QP87 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm2035J3QP87 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm2035J3QP87 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm2035J3QP87 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2035J3QP87 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2035J3QP87 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2035J3QP87 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2035J3QP87 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2035J3QP87 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2035J3QP87 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2035J3QP87 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2035J3QP87 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2035J3QP87 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2035J3QP87 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2035J3QP87 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2035J3QP87 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2035J3QP87 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2035J3QP87 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2035J3QP87 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2035J3QP87 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2035J3QP87 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2035J3QP87 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2035J3QP87 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2035J3QP87 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2035J3QP87 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2035J3QP87 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2035J3QP87 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2035J3QP87 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2035J3QP87 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2035J3QP87 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2035J3QP87 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2035J3QP87 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2035J3QP87 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2035J3QP87 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2035J3QP87 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2035J3QP87 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2035J3QP87 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2035J3QP87 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2035J3QP87 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2035J3QP87 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2035J3QP87 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2035J3QP87 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2035J3QP87 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2035J3QP87 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2035J3QP87 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2035J3QP87 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2035J3QP87 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2035J3QP87 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2035J3QP87 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2035J3QP87 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2035J3QP87 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2035J3QP87 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm2035J3QP87 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm2035J3QP87 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm2035J3QP87 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm2035J3QP87 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm2035J3QP87 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm2035J3QP87 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm2035J3QP87 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm2035J3QP87 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm2035J3QP87 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm2035J3QP87 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm2035J3QP87 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2035J3QP87 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2035J3QP87 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2035J3QP87 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2035J3QP87 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2035J3QP87 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2035J3QP87 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2035J3QP87 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2035J3QP87 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2035J3QP87 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2035J3QP87 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2035J3QP87 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2035J3QP87 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2035J3QP87 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2035J3QP87 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2035J3QP87 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2035J3QP87 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2035J3QP87 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2035J3QP87 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2035J3QP87 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2035J3QP87 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2035J3QP87 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2035J3QP87 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2035J3QP87 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2035J3QP87 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2035J3QP87 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2035J3QP87 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2035J3QP87 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2035J3QP87 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2035J3QP87 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms