Protein–RNA interactions for Protein: J3QNY8

Gm19965, Predicted gene, 19965, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm19965J3QNY8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm19965J3QNY8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm19965J3QNY8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm19965J3QNY8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm19965J3QNY8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm19965J3QNY8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm19965J3QNY8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm19965J3QNY8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm19965J3QNY8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm19965J3QNY8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm19965J3QNY8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm19965J3QNY8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm19965J3QNY8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm19965J3QNY8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm19965J3QNY8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm19965J3QNY8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm19965J3QNY8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm19965J3QNY8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm19965J3QNY8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm19965J3QNY8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm19965J3QNY8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm19965J3QNY8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm19965J3QNY8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm19965J3QNY8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm19965J3QNY8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm19965J3QNY8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm19965J3QNY8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm19965J3QNY8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm19965J3QNY8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm19965J3QNY8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm19965J3QNY8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm19965J3QNY8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm19965J3QNY8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm19965J3QNY8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm19965J3QNY8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm19965J3QNY8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm19965J3QNY8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm19965J3QNY8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm19965J3QNY8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm19965J3QNY8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm19965J3QNY8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm19965J3QNY8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm19965J3QNY8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm19965J3QNY8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm19965J3QNY8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm19965J3QNY8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm19965J3QNY8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm19965J3QNY8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm19965J3QNY8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm19965J3QNY8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm19965J3QNY8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm19965J3QNY8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm19965J3QNY8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm19965J3QNY8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm19965J3QNY8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm19965J3QNY8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm19965J3QNY8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm19965J3QNY8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm19965J3QNY8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms