Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c2J3QNM1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c2J3QNM1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c2J3QNM1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c2J3QNM1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c2J3QNM1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c2J3QNM1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c2J3QNM1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c2J3QNM1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34c2J3QNM1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
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