Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS2

1700014D04Rik, MCG148436, mousemouse

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700014D04RikJ3QMS2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700014D04RikJ3QMS2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700014D04RikJ3QMS2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700014D04RikJ3QMS2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700014D04RikJ3QMS2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700014D04RikJ3QMS2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700014D04RikJ3QMS2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700014D04RikJ3QMS2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700014D04RikJ3QMS2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700014D04RikJ3QMS2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700014D04RikJ3QMS2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700014D04RikJ3QMS2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700014D04RikJ3QMS2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
1700014D04RikJ3QMS2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
1700014D04RikJ3QMS2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
1700014D04RikJ3QMS2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
1700014D04RikJ3QMS2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
1700014D04RikJ3QMS2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
1700014D04RikJ3QMS2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
1700014D04RikJ3QMS2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700014D04RikJ3QMS2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms