Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3336J3QMQ6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3336J3QMQ6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3336J3QMQ6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3336J3QMQ6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3336J3QMQ6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3336J3QMQ6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3336J3QMQ6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3336J3QMQ6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3336J3QMQ6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3336J3QMQ6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3336J3QMQ6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3336J3QMQ6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3336J3QMQ6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3336J3QMQ6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3336J3QMQ6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3336J3QMQ6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3336J3QMQ6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3336J3QMQ6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3336J3QMQ6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3336J3QMQ6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3336J3QMQ6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3336J3QMQ6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3336J3QMQ6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3336J3QMQ6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3336J3QMQ6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3336J3QMQ6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3336J3QMQ6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3336J3QMQ6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3336J3QMQ6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3336J3QMQ6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3336J3QMQ6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3336J3QMQ6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3336J3QMQ6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3336J3QMQ6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3336J3QMQ6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3336J3QMQ6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3336J3QMQ6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3336J3QMQ6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3336J3QMQ6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3336J3QMQ6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3336J3QMQ6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3336J3QMQ6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3336J3QMQ6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3336J3QMQ6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3336J3QMQ6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3336J3QMQ6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3336J3QMQ6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3336J3QMQ6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3336J3QMQ6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3336J3QMQ6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3336J3QMQ6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3336J3QMQ6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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