Protein–RNA interactions for Protein: J3QM72

Gm20834, Predicted gene, 20834, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20834J3QM72 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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