Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3727J3QM54 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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