Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c3J3QJW5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c3J3QJW5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c3J3QJW5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c3J3QJW5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c3J3QJW5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c3J3QJW5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c3J3QJW5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c3J3QJW5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c3J3QJW5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c3J3QJW5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c3J3QJW5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c3J3QJW5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c3J3QJW5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c3J3QJW5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34c3J3QJW5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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