Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
AK157302I3ITR1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms