Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tubgcp6G5E8P0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tubgcp6G5E8P0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tubgcp6G5E8P0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Tubgcp6G5E8P0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tubgcp6G5E8P0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tubgcp6G5E8P0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tubgcp6G5E8P0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tubgcp6G5E8P0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tubgcp6G5E8P0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tubgcp6G5E8P0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tubgcp6G5E8P0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tubgcp6G5E8P0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tubgcp6G5E8P0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tubgcp6G5E8P0 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Tubgcp6G5E8P0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tubgcp6G5E8P0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tubgcp6G5E8P0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tubgcp6G5E8P0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tubgcp6G5E8P0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tubgcp6G5E8P0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tubgcp6G5E8P0 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Tubgcp6G5E8P0 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tubgcp6G5E8P0 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tubgcp6G5E8P0 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tubgcp6G5E8P0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tubgcp6G5E8P0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tubgcp6G5E8P0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tubgcp6G5E8P0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tubgcp6G5E8P0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tubgcp6G5E8P0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tubgcp6G5E8P0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Tubgcp6G5E8P0 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tubgcp6G5E8P0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tubgcp6G5E8P0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tubgcp6G5E8P0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Tubgcp6G5E8P0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tubgcp6G5E8P0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tubgcp6G5E8P0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tubgcp6G5E8P0 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Tubgcp6G5E8P0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Tubgcp6G5E8P0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tubgcp6G5E8P0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tubgcp6G5E8P0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tubgcp6G5E8P0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tubgcp6G5E8P0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tubgcp6G5E8P0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tubgcp6G5E8P0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tubgcp6G5E8P0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tubgcp6G5E8P0 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tubgcp6G5E8P0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tubgcp6G5E8P0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tubgcp6G5E8P0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tubgcp6G5E8P0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tubgcp6G5E8P0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tubgcp6G5E8P0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tubgcp6G5E8P0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tubgcp6G5E8P0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tubgcp6G5E8P0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tubgcp6G5E8P0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tubgcp6G5E8P0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms