Protein–RNA interactions for Protein: G3X939

Slc9a3, Sodium/hydrogen exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3G3X939 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc9a3G3X939 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc9a3G3X939 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc9a3G3X939 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc9a3G3X939 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc9a3G3X939 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc9a3G3X939 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc9a3G3X939 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc9a3G3X939 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc9a3G3X939 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc9a3G3X939 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc9a3G3X939 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc9a3G3X939 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc9a3G3X939 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc9a3G3X939 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc9a3G3X939 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc9a3G3X939 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc9a3G3X939 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc9a3G3X939 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc9a3G3X939 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc9a3G3X939 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc9a3G3X939 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc9a3G3X939 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc9a3G3X939 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc9a3G3X939 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc9a3G3X939 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc9a3G3X939 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc9a3G3X939 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc9a3G3X939 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc9a3G3X939 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc9a3G3X939 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc9a3G3X939 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc9a3G3X939 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc9a3G3X939 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc9a3G3X939 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc9a3G3X939 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc9a3G3X939 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc9a3G3X939 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc9a3G3X939 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc9a3G3X939 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms