Protein–RNA interactions for Protein: G3UXD1

Speer4c, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4cG3UXD1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Speer4cG3UXD1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Speer4cG3UXD1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Speer4cG3UXD1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Speer4cG3UXD1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Speer4cG3UXD1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Speer4cG3UXD1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Speer4cG3UXD1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Speer4cG3UXD1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Speer4cG3UXD1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Speer4cG3UXD1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Speer4cG3UXD1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Speer4cG3UXD1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Speer4cG3UXD1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Speer4cG3UXD1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms